与多民族的中国不同，日本的主体民族为单一的大和民族。主流宗教也是神道教与佛教。在德川幕府时期，也曾有西方传道士试图在日本国土上传教，但都受到了统治阶级的打击。
至明治时期对外开国的政策实行，日本在与西方频繁接触的同时，也与各阿拉伯、伊斯兰国家发展关系，进行往来。
一些前往经商、旅游和学习的日本民间人士，看到穆斯林独特的生活方式后便开始对伊斯兰教及其经典、思想、制度等进行研究，在国内发表文章予以介绍，并从理论上进行探讨。
但因神道思想深入人心，当地信奉伊斯兰教者不多，在社会上亦无过大影响。
伊斯兰教在日本
部分旅居阿拉伯、印度和土耳其等国的日本青年知识分子，因与当地穆斯林交往甚密而信奉了伊斯兰教，他们归国后实行伊斯兰生活方式，著文介绍伊斯兰教义、教法和教规知识，这些人遂成为较早期的日本穆斯林。
30年代，在日本学术界和政界曾出现研究伊斯兰教的热潮：
1932年有17名学者发起成立了“伊斯兰教文化研究所”，出版《伊斯兰文化》杂志，
1937年另有部分学者成立了“伊斯兰教圈研究所”，出版了《回教圈》月刊，
1938年一些政界人士成立了“大日本伊斯兰教协会”，出版《回教世界》月刊；
1940年部分穆斯林成立了“东京伊斯兰教团”。
在日本人中，信仰伊斯兰教的穆斯林在总人口中不足1%，是非常少的。对日本人来说，伊斯兰教是个遥远的存在，对宗教本身也没有充分的认识。
近年来伊斯兰教在日本的发展非常迅速。虽然本土日本人对伊斯兰教的了解甚少，但是日本的各个清真寺都在努力的宣传，积极的参与社会活动，希望能够建立一座沟通的桥梁。
下山茂，任职于东京清真寺文化中心。1979年生于冈山县。曾在埃及尼罗河流域考察一年，回国后，在出版社任职并参与了日本伊斯兰教中心的创设工作。
东京清真寺在印度尼西亚、马来西亚等东南亚穆斯林中，是与京都、富士山、迪斯尼乐园齐名的观光名胜，还被排进了旅游团的景点中。
来日本旅游的穆斯林越来越多。所以，日本政府已经在致力于提供更多的清真餐厅、礼拜设施完备的饭店等。
东京大清真寺
1917年，俄罗斯爆发了革命，许多原本在俄罗斯境内居住的土耳其(也包括突厥系少数民族)居民因害怕政治迫害，所以不得不从俄罗斯出来避难。
其中，由喀山州出来，经过满洲到达日本的大多数土耳其人都定居在了东京。1922年，成立了玛哈雷.易.伊斯拉米耶协会，于1937年,为了给难民的孩子们提供应有的教育，设立了富之谷小学的分校。
1938年,在日本政府的援助下，难民们第一个礼拜场所，东京伊斯兰学校成立，在这个礼拜场所建设的过程中，两位土耳其难民阿布杜尔哈尤·库尔班·阿里和阿布杜尔雷西特·易伯拉欣两人指挥了整个工程。
土耳其于1997年，以土耳其共和国宗教厅长官穆罕默德·尤里·尤尔玛兹为总裁，设立了“东京清真寺建设基金会”。
该基金会收到了来自土耳其全国各地的捐款，不只是捐款，现在东京清真寺的建筑材料里，除了水和水泥之外，全都是从土耳其运到日本的。
同时，土耳其政府还派了近100名建筑师和美术师到日本，在一年多的时间里，为东京清真寺进行建筑设计和美术装饰的工作。
于1998年6月30日开始的清真寺建设工作，在日本和土耳其两国的共同努力下，经过两年的工作完工。
.2000年6月30日，举行了盛大的开馆仪式，东京清真寺终于恢复了作为一个礼拜，信息交流和不同文明进行交流对话的场所的功能。
东京清真寺土耳其文化中心的建筑物的建筑主体工程，是由鹿岛建设株式会社完成的。
设计图纸是由现在土耳其杰出的宗教建筑设计大师穆哈雷穆·西里米·谢纳尔普设计的。
内部的装修和装饰工作，完全由来自土耳其的美术工作者们完成的。
日本方面,总工程师是鹿岛建设的伊藤澄男和若林明两人，工地主管是古川鹤喜，副主管是小俣悌二。土耳其方面的工程总管是萨米·戈隆，工地主管是穆斯塔法·依斯肯戴尔。
东京清真寺的庆祝诗词，是土耳其现代诗的一位有代表的著名诗人依斯肯戴尔·巴拉教授所写的。在礼拜寺完工的日期下面，刻上了这首诗。
感谢，感谢，迎来了开馆之日的这座清真寺。
令全体伊斯兰教徒都欣喜万分的这座清真寺。
虽然过去也是乐园。
鸟儿们都飞走了，而变得寂寞的这座清真寺。
当奇迹出现的时候,连日本人也感动了。
在土耳其工匠的手里，
又一次获得重生的这座清真寺.
美丽姿态又复活了高塔
让信者们再次聚集到一起的这座清真寺。
无论是在现世还是在来世,都永远铭刻这个日期。
在太阳之国，成为了一缕圣光的东京清真寺。
——伊斯兰历1419年-1421年
作为世界三大宗教之一的伊斯兰教，在百年间已经受到越来越多日本民众的关注与了解，但由于文化差异，日本民众对伊斯兰教的认识很少，甚至存在一定误解。
毫无疑问，日本穆斯林的人生观和生活意识与日本社会和伊斯兰教息息相关。日本穆斯林并不是独立存在的群体，而属于日本公民社会，必须要同日本社会建立关系，对社会负有一定的责任。
穆斯林树立社会责任意识，同样是对伊斯兰教精神的继承与弘扬。有理由相信，在日本穆斯林不断树立社会责任意识的努力下，日本社会对伊斯兰教将会有全新的认识、足够的包容心和理解力，日本穆斯林社会也会不断发展和壮大。
日本清真寺分布一览表
编号 名称 地址/所属辖区 成立时间
1 神户清真寺 兵库县神户市 1935
2 东京清真寺 东京都涉谷区 1938（2000年重建）
3 一之割清真寺 崎玉县春日部市 1991
4 伊势崎清真寺 群马县伊势崎市 1995
5 成增清真寺 东京都葛饰区 1995
6 日向市清真寺 千叶县日向市 1995
7 境町清真寺 群马县佐波郡区 1996
8 市川市清真寺 千叶县市川市 1997
9 海老名市清真寺 神奈川县海老名市 1998
10 名古屋市清真寺 爱知县名古屋市 1998
11 户田清真寺 崎玉县户田市 1999
12 大冢清真寺 东京都利岛区 1999
13 富山清真寺 富山县新凑市 1999
14 御花茶屋清真寺 东京都葛饰区 2000
15 鸟取县清真寺 崎玉县鸟取市 2000
16 浅草清真寺 东京都 2000
17 足利市清真寺 枥木县足利市 2000
18 筑波清真寺 茨城县筑波市 2001
19 新安城清真寺 爱知县 2001
20 高松清真寺 香川县 2001
21 白井市清真寺 千叶县白井市 2001
22 富士清真寺 静冈县 2001
23 大阪清真寺 大阪府 2001
24 八王子清真寺 东京都八王子市 2002
25 岐阜县清真寺 岐阜县岐阜市 2002
26 新泻清真寺 新泻市 2002
27 馆林市清真寺 群马县馆林市 2003
28 新居滨市清真寺 爱媛县新居滨市 2003
29 蒲生清真寺 崎玉县 2003
30 小山市清真寺 枥木县小山市 2005
31 磐城市清真寺 福岛县磐城市 2005
32 京都清真寺 京都府京都市 2005
33 横滨清真寺 神奈川县横滨市 2006
34 所泽清真寺 崎玉县 2006
35 丰田市清真寺 爱知县丰田市 2006
36 名古屋港口清真寺 爱知县名古屋市 2006
37 滨松清真寺 静冈县 2006
38 坂城町清真寺 长野县 2006
39 大阪茨城县清真寺 茨城县大阪市 2006
40 仙台市清真寺 宫城县仙台市 2007
41 札幌清真寺 北海道 2007
42 春日井市清真寺 爱知县春日井市 2007
43 结城市清真寺 茨城县结城市 2008
44 德岛县清真寺 德岛县德岛市 2008
45 小樽市清真寺 北海道小樽市 2008
46 坂户市清真寺 崎玉县坂户市 2008
47 岐阜县清真寺 岐阜县岐阜市 2008
48 福冈市清真寺 福冈市 2008
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